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cfDNA(cell free DNA)指存在于人体血液循环中的、游离于细胞外的高度片段化DNA。在特定情况下(如肿瘤患者、孕妇、接受器官移植的患者等),一小部分来自“异源性”细胞的cfDNA(如肿瘤细胞、胎儿细胞、或供体细胞)可以作为基因检测的标志物。其中死亡的肿瘤细胞破裂后所释放出来的、片段化的基因组 DNA也称之为ctDNA(circulating tumor DNA)。基于cfDNA检测的“液态活检”技术在产前诊断、肿瘤的筛查、早期诊断、治疗监测和预后评估等多个方面受到极大的关注。
细胞主动裂解(又叫细胞凋亡)过程中产生的“DNA ladder”式的片段化核酸,它们的大小基本上在150-200bp左右。人体是一个庞大而复杂的循环系统,其中的运作周而复始,循环往复。除了整个人体的大循环,还有组成人体的各个部件各自的“小循环”,简单来说,就是人体各个器官更换状态的周期。一般情况下,人体会在半年内更新掉身体的98%组织的细胞,也就是说每天每时每刻我们体内都不断地有细胞在凋亡又有新的细胞在形成。
细胞被动裂解——这种裂解的方式就有很多,既可以来源于外界物理或者化学刺激引发的组织坏死,也可以是自身免疫系统对细胞杀伤作用,不同的是这个过程产生的核酸很大,会接近基因组DNA大小。
方法一:酚-氯仿
原理: 利用核酸DNA不溶于有机溶剂的方法将DNA与其他杂质分离
优点: 成本低;设备要求低。
缺点: 操作繁琐;回收率低;抑制物残留多;试剂含有毒成分。
方法二:硅胶柱
原理: 核酸在高盐条件下与硅胶膜结合,在低盐、高PH值时核酸从硅胶膜上洗脱下来,经过多次离心转管收集
优点: 纯度高;成本较低。
缺点: 需多次高速离心,操作步骤多;负压抽吸,开放式操作,效率低,易形成交叉污染;
吸附柱会出现堵塞现象;回收率低,损失量大,不适合小片段提取;不同试剂保存条件不一致,易丢失。
方法三:磁珠法
原理: 精制的超顺磁纳米硅磁珠在盐溶液条件下特异性吸附血液中的游离核酸,将吸附核酸的磁珠转移至低盐等条件下将其洗脱下来。
优点: 纯度高;回收率高,小片段同样可纯化;可自动化操作。
缺点: 国外进口试剂成本高。
1. 检测cfDNA片段大小
a)利用凝胶电泳检测,但是不能精确检测片段大小;
b)利用qPCR检测, 但只能检测事先选定的位点,并不适合基因组范围的分析;
c)利用电镜检测, 但费时费力,效率低;
d)利用大规模测序平台检测;
2. cfDNA相关的分子检测
利用计算窗口化保护评分(windowedprotectionscore,缩写wps)进行检测,即:片段大小=在基因组里面一个特殊的点内跨越120bp的DNA片段数量-有端点的片段的数量。它和核小体距离有相关性。我们可以根据核小体的距离来推测cfDNA的来源。
3. 检测目的
a)检测cfDNA的大小可以知道它是由哪种细胞死亡机制产生的:~10000bp的cfDNA由细胞坏死产生;140-200bp的cfDNA由细胞凋亡产生;313-798bp的为孕妇cfDNA;
b)检测 cfDNA相关分子信号,比如甲基化,以及核小体距离可以追溯它的组织来源;
c)检测特定序列的cfDNA的种类数量的变化可以判断癌症,以及相关疾病。
血中cfDNA在疾病的早期诊断、预后、监测等方面具有重要潜在价值。其具体医学应用大致包括以下方面:
a)用于产前诊断;
b) 用于免疫性疾病等非肿瘤类疾病的病情分析与疗效观察;
c)用于肿瘤相关分析。
在上述三类应用中,其在肿瘤分析中的价值尤为重要,虽然目前血中cfDNA分析尚未列为临床必需的检测指标,但数以千计的研究论文和大量一期和二期临床试验的数据,有力支持这一新技术在肿瘤防治中的巨大应用价值:
a)肿瘤的早期诊断;
b)肿瘤治疗方案确定;
c)肿瘤疗效观察;
d)肿瘤预后评估;
e)肿瘤转移风险分析;
f)肿瘤复发监测。
魏祎 | 文案
给你讲个案例:
软件公司营销总监马克丁先生不但自己是个营销高手,他还特别善于“传帮带”,培养了不少得意门生。这天,手下文案专员小陈正在为写一篇马上就要送媒体发表的“软文(软性宣传文章)”苦思冥想,绞尽脑汁。
老马见状,拿起小陈的稿子一看,只见文章的开头写道:“本公司是全国规模最大、技术水平最先进、产品开发力量最强、服务响应速度最快的软件企业。”看到这么多的修饰词和如此冗长的句法,老马不由得大失所望,他训示道:“小陈呀小陈,亏你还是名校毕业的高材生,怎么连营销文案遣词造句的基本窍门都不懂呢?”
小陈自知理亏,不好意思地说:“我想说咱们公司规模最大、产品最好、服务最佳……总之啥都是第一,可是发现要吹的东西太多,结果就凑了一堆形容词。实在没办法,还请马总指正。”
尽管是恨铁不成钢,老马还是谆谆教诲道:“搞这么多形容词,无非是想让读者看到文章后觉得咱们方方面面都很‘牛’嘛。我用一个词就可以把这个说透了。”
小陈惊讶地说:“有这么厉害的词吗?!”
为了让“门徒”早日成长,老马耐心地讲解道:“‘软文’是软宣传,要以普通新闻报道的形式转弯抹角地给读者灌‘迷药’,因此最忌讳‘硬’,你用这么多扎眼的形容词,读者一眼就看出来了,‘迷药’不就失灵了。以这篇文章为例,为了‘避硬就软’,你得用一个名词来比喻咱们公司。你觉得应该用啥名词?”
小陈犹豫着回答说:“领袖?”
老马说:“不是。这篇文章的主题是本公司规模大、产品好、速度快、水平高、实力强,具有这种特征的东西只有一个——航空母舰,简称‘航母’。”
小陈豁然开朗道:“我明白了!‘航母’能立竿见影地在目标受众的头脑中树立这样的形象,它真是个点石成金的词儿!”
为了让小陈理解得更透彻,老马继续举例说明:“‘航母’是个名词,可与一系列的动词排列组合,让读者的脑海在瞬间形成一幅生动画面。例如,要报道本公司总裁莅临某海滨或江滨城市洽谈投资事宜,哪怕只是谈个初步意向,你也可以站在当地媒体报道招商政绩的角度描写道‘软件航母驶入XX滩/XX江’;如果是计划在当地开发区买地造楼,就报道‘软件航母即将入驻XX软件园’。这样既起到宣传自己的作用,又给了东道主面子,宾主尽欢。明白了吗?”
小陈拍手称道:“妙!真妙!”
老马说:“明白了就好。如果希望读者认为本公司产品的技术水平全国第一、领先对手,该怎样表述呢?”
小陈眼睛骨碌一转,马上就说:“应该写‘X公司斥巨资打造航母版管理软件’。尽管咱们研发新一代软件的事情八字还没一撇呢,但‘航母版产品’这个描述能让读者联想到重量级产品;对于那些半拉子产品,即使是缺胳膊少腿的‘零部件’,也可以说成‘航母级软件的核心动力系统已经通过国家级专家测试,达到国际领先水平’。”
看到爱徒果然是块好材料,老马心里乐开了花。他补充道:“说自己是‘航母’比直接说‘在某某方面中国第一’要好。因为第一需要实打实的数字,得有硬指标作为根据,要人信服还得找来德高望重的第三方作保,否则就会给人自卖自夸的不良印象。‘航母’不但给读者以无限的想像空间,而且不会把自己框死。”
小陈的悟性显然不低,点拨一下就能够举一反三。他说:“还有如果要写‘本公司拟发行新股圈钱’,就可以以财经动态报道的口吻说:‘X公司拟融资打造世界级软件航母’;如果本公司要收购其他公司或相互合并,可说‘强强联合 打造产业航母’;如果本公司与其他公司进行战略合作,就写‘合力组建超级航母战斗群’……”
老马赞许地笑了,他接过话茬说:“还可以引申一下,让航母动起来。例如要报道公司在境外设立了办事处,可说‘中国软件航母驶出国门、扬帆出海、抢滩欧洲、登陆东瀛’。”
经过老马一番辅导,小陈不由得心服口服叹道:“光‘航母’俩字儿就能抖搂出这么多花样!马总,看来这小小软文的遣辞造句的学问还真大!”
只听老马语重心长地忠告说:“你明白就好。文字功夫从来都没有‘一招鲜吃遍天’的,用‘航母’来作比喻只是一个窍门,要真正成为文案高手,还得靠你多琢磨、勤推敲。”
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